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Los métodos convencionales para identificar hongos se basan en identificar los síntomas de la enfermedad, seguido de cultivo de hongos e identificación por morfología y test bioquímicos. Sus principales desventajas es que requieren personal entrenado y con experiencia, que el hongo pueda ser cultivado (toma tiempo) y que puede haber contaminación en el cultivo y error en identificación y no es posible cuantificar la carga.

La detección molecular se lleva a cabo considerando estos 3 pasos:

  • Selección del la secuencia blanco específica de DNA/RNA del genoma del hongo para identificarlo.
  • Extracción de DNA/RNA  de la muestra (difícil con hongos filamentosos).
  • Método de detección  de la secuencia blanco.

El DNA ribosomal del núcleo del hongo (rDNA) consiste en 3 genes, la sub-unidad grande del gen (25S), la sub-unidad pequeña (18S)  y el gen 5.8S, separados por la región del espacio  transcrito externo (ITS).

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Universidad de Concepción - Chile
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